Zavod upravlja Svet zavoda. Sestavljajo ga predstavniki ustanoviteljice, predstavniki delavcev in predstavniki staršev.

Svet zavoda šteje 11 članov:

• 3 predstavniki ustanoviteljice,
• 5 predstavnikov delavcev zavoda,
• 3 predstavniki staršev.

Predstavnike ustanoviteljice imenuje Občinski svet Občine Ankaran.

Predstavnike delavcev izvolijo zaposleni delavci zavoda, in sicer:

• dva predstavnika izmed strokovnih delavcev šole,
• dva predstavnika izmed strokovnih delavcev vrtca in
• enega predstavnika izmed upravno-administrativnih in tehničnih delavcev.

Predstavnike staršev volijo starši na Svetu staršev, in sicer:

• dva predstavnika izmed staršev, katerih otroci obiskujejo osnovno šolo,
• enega predstavnika izmed staršev, katerih otroci obiskujejo vrtec.

Predsednik Sveta zavoda je Mirko Zorman

Člani Sveta zavoda OŠV Ankaran so:

Predstavniki delavcev:

• Nataša Jerman
• Igor Smolnik
• Miha Franca
• Zorica Krstič
• Valentina Šukljan

Predstavniki staršev:

• Petra Privošnik
• Bojan Ferlež
• Veronika Kruljac

Predstavniki lokalne skupnosti:

• Mirko Zorman
• Mirella Ceglar Jurinčič
• Katja Pišot Maljevac